Всі методики застосування БОС можна умовно розділити на дві групи: активаційний тренінг і релаксаційний (розслабляючий) тренінг.

• Активаційний тренінг використовується в лікуванні синдрому дефіциту уваги з переважанням неуважності. Відзначено, що після такого курсу діти стають уважнішими, поліпшується успішність. Такий тренінг використовується також в лікуванні астенічних станів, що характеризуються підвищеною неуважністю.
• Релаксаційний тренінг використовується у дітей з переважанням в поведінці гіперактивності й імпульсивності. За допомогою такого тренінгу можна домогтися зменшення тиків, страхів. Діти стають спокійнішими, поліпшується поведінка в школі та вдома.

Метод БОС також використовується в лікуванні неврастенії, мігрені, головних болів, напруги, неврозів.

Курс БОС становить в середньому від 8 до 30 сеансів, заняття проводяться 2-5 разів на тиждень, залежно від стану та можливостей клієнтів, а також реакції на процедури. Перевагою цього методу є активна участь пацієнта в корекційної процесі. Метод абсолютно безпечний, тому що при його використанні не виявляється фізичного впливу, а відбувається психофізіологічний тренінг, в ході якого мозок навчають працювати в правильному режимі.